В соответствии с протоколом, подписанным между Вооруженными силами Азербайджана и Турции 5 апреля 2000 года, согласно приказу министра обороны Азербайджанской Республики от 20 февраля 2001 года, в связи с применением в Вооруженных Силах Азербайджана системы обучения НАТО, с 26 марта 2001 года на базе курсов усовершенствования офицерского состава, подготовки гизирей и подготовки офицеров запаса начал функционировать Учебно-тренировочный центр Азербайджанской Армии. Учебно-тренировочный центр является дополнительным образовательным учреждением, осуществляющим подготовку кадров по востребованным в Азербайджанской Армии направлениям и специальностям. Дополнительное образование обеспечивает совершенствование кадрового потенциала, адаптацию военнослужащих к постоянно меняющимся условиям службы. В Учебно-тренировочном центре Азербайджанской Армии действуют следующие курсы:
– курсы усовершенствования офицерского состава – дополнительное образование, проводимое в соответствии с требованиями Азербайджанской Армии в целях повышения профессионального уровня и качества службы офицерского состава всех уровней и категорий, формирования и развития профессиональных навыков, приобретения более современных профессиональных умений и способностей;
– курсы подготовки офицеров запаса – дополнительное образование, обеспечивающее подготовку офицерских кадров по соответствующим специальностям с целью создания офицерского резерва. Успешно окончившим курс присваивается воинское звание "лейтенант" приказом министра обороны;
– курсы подготовки гизирей – это образование, предоставляемое по специальности, которое обеспечивает подготовку личного состава для службы в соответствующих командных и специальных должностях. Успешно окончившим курс присваивается звание "гизирь”;
- курсы подготовки военнослужащих сверхсрочной действительной военной службы –обучение по специальности, обеспечивающей подготовку кадров для службы на соответствующих командных и специальных должностях. Успешно окончившим курс присваивается звание "младший сержант".
Офицеры и гизири Учебно-тренировочного центра Азербайджанской Армии принимал участие в боевых действиях, проводимых в ходе Второй карабахской войны, из них 21 военнослужащий, получив телесные повреждения различной степени, стали гази. За проявленное мужество более 500 военнослужащих Учебно-тренировочного центра были награждены орденами и медалями.
В целях совершенствования деятельности сети учебных заведений специального назначения Указом Президента Азербайджанской Республики господина Ильхама Алиева от 5 марта 2022 года номер 1626 Учебно-тренировочный центр Азербайджанской Армии был передан в подчинение Национального университета обороны.